2003年，我校向菲律宾派出了中华人民共和国成立以来首批汉语教师志愿者，自此以来，我校每年至少组一次以校领导为团长的访问团赴菲律宾交流，深入到菲律宾主流学校、华文学校、菲华商联总会、菲律宾华文教育研究中心、菲律宾华文学校联合会等开展交流合作与田野调查，并拜会菲律宾议会众议长、教育部官员、地方市长等政府高层和政要。研究中心的工作人员和研究者以因私、因公出国等方式赴菲律宾开展相关研究和调查60多次，搜集到了丰富的第一手资料。

2004年至今，我校每年都承担国家汉办派赴菲律宾汉语教师志愿者的培训任务。2004年至今，我校与菲律宾中正学院合作以“2+2模式”，共为为菲律宾培养了近百名华文教师。

2005年，我校成立了“海外华文教育研究中心”，菲律宾航空公司董事长、菲华侨领、菲华商联总会永远名誉理事长陈永栽任中心名誉主任。同年，我校与菲律宾著名高等院校——亚典耀大学在汉语教学和文化传播开展了交流与合作。

2006年，在菲律宾阿罗约总统和福建省委书记卢展工见证下，我校与菲律宾菲华商联总会签署了合作创办菲律宾中国语言文化学院的协议。

2007年，我校的“菲律宾中国语言文化学院”揭牌成立。这一年，菲律宾华人邵建寅冠名我校图书馆（又玄图书馆）、佘日章冠名行政楼（佘明培楼）。

2008年菲律宾驻华大使访问我校，推进我校与菲律宾教育合作与交流。自2008年起，我校与菲律宾雅典耀大学开展了共建孔子学院与菲律宾研究的合作，选派教师到对方访学及教授汉语。同时，与雅典耀大学中国问题研究中心进行学术合作研究。该中心主任Sidney Christopher T. Bata，博士/教授、Ayette C. Ferriols，博士/副教授受聘为菲律宾研究中心兼职教授，双方研究人员合作出版专著、发表文章10余项。

2009年，我校与菲律宾国际科技学院合作开展远程网络汉语教学。

2010年，我校与菲律宾红溪礼示大学合作创办的孔子学院正式揭牌，菲律宾总统阿罗约为孔子学院揭牌，推动了我校面向菲律宾主流社会的合作与研究走上新台阶。2010年至今，我校菲律宾孔子学院已经连续三次获得“全球先进孔子学院”称号，多次获得汉语水平考试“全球先进考点”称号，在全菲下设93个汉语教学点，汉语教学辐射全菲。

2011年，菲律宾教育部部长与我校菲律宾孔子学院签署支持菲律宾主流中学开展汉语教学的合作协议。

2012年，在我校菲律宾孔子学院推动下，汉语被菲律宾教育部正式纳入国家“特别外语项目”。

2017年，我校菲律宾孔子学院在总统府马拉卡南宫为总统府官员开设汉语课。同年，在建校110周年校庆之际，我校成立了以菲律宾总统杜特尔特母亲命名的“索莱达学院”，我校菲律宾校友许明良先生捐建近一万平方米的索莱达学院大楼，作为菲律宾研究中心和海外留学生教学使用。